该核心的职能包括：确保在食品中添加的物质及色素的平安；确保通过生物工艺开发的食品和配料的平安；负责在正确标识食品（如成分、营养健康声明）和化妆品方面的管理活动；制定相应的政策和法规，以管理膳食补充剂、婴儿食物配方和诊疗食品；确保化妆品成分及产品的平安，确保正确标识；监督和规范食品行业的售后行为；进行消费者教育和行为拓展；与州和地方政府的合作项目；协调国际食品标准和平安等。
2、药品评估和研究核心（CDER):
该核心旨在确保处 方药和非处 方药的平安和有用，在新药上市前对其进行评估，并监督市场上销售的一万余种药品以确保产品满足不断更新的非常高标准。同时，该核心还监管电视、广播以及出版物上的药品的广告的真实性。严格监管药品，提供给消费者准确平安的信息。
3、设备平安和放射线保护健康核心（CDRH):
该核心在确保新上市的诊疗器械的平安和有用。因为在世界各地有两万多家企业生产从血糖监测仪到人工心脏瓣膜等超过八万种各种类型的诊疗器械。这些产品都是同人的生命息息相关的，因而该核心同时还监管全国范围内的售后服务等。对于一些象微波炉、电视机、移动电话等能产生放射线的产品，该核心也确定了一些相应的平安标准。
4、生物制品评估和研究核心（CBER):
该核心监管那些能够预防和诊疗病疼的生物制品，因此比化学综合性药物更加复杂，它包括对血液、血浆、疫苗等的平安性和有用性进行科学研究。
5、兽用药品核心（CVM):